說實話《大唐女法醫》的大結局有些匆忙，蘇伏(裴子添 飾)一直都是對冉顏(周潔瓊 飾)死心塌地的，傷害誰也不會傷害她，可是這次居然對冉顏動手。所有情節都讓人猝不及防，蘇伏黑化，蕭頌(李程彬 飾)假死，冉云生(孫濤 飾)成最大反派。

　　蘇伏為救冉顏吞下傀儡藥，受東陽夫人(高蓓蓓 飾)控制，藥力發作時竟然產生幻覺狂性大發，連冉顏也不放過。冉顏在關鍵時刻拿出他們的信物，這才喚醒了蘇伏的本性，躲過一劫。

　　火麒社為離間皇帝與蕭頌，陷害蕭頌有謀反之心，不想就這樣吃下啞巴虧的蕭頌只能逃走。此時的蘇伏已經被黑化，他恨蕭頌奪走冉顏，以大理寺官員的身份對他窮追不舍，最后在眾人的圍攻下，蕭頌被蘇伏的箭頭擦傷，突然口吐鮮血而亡。

　　但是冉顏不相信蕭頌已經死去的事實，她說是要給蕭頌驗尸，可是卻拿起解剖刀劃開手腕，企圖自盡。蘇伏慌了，連忙將她拉開包扎，在拉扯期間，蕭頌身上掉出一朵黑色杜鵑花，冉顏這才明白蕭頌是假死，必須救活她。

　　冉顏用障眼法騙過所有人，將蕭頌救活，他們聯手皇上來一招甕中捉鱉，利用隋侯之珠的下落把火麒社的人引到大殿。

　　冉顏一直以為東陽夫人是火麒社的頭領，沒有想到她的上面還有主人，冉顏的堂哥冉云生居然是隋朝后裔，他才是火麒社的頭領。為了反唐復隋建立了火麒社，欲奪取隋侯之珠推翻大唐。

　　冉云生蟄伏于市這么久就等今天，可是他千算萬算，還是沒有算到蕭頌與皇上聯手對付他。火麒社大勢已去，東陽夫人被蘇伏殺死，冉云生身捆炸藥抓住冉顏打算同歸于盡。

　　不得不說，在關鍵時刻蘇伏和蕭頌還是很有默契的，他們一個眼神對視就已定好分工，突然一起沖出，蕭頌救出冉顏，蘇伏與冉云生一起滾下階梯，炸彈引發爆炸，現場一片血肉橫飛。

　　火麒社已滅，皇上論功行賞，但是冉顏是冉云生的堂妹，皇上下令讓冉顏離開京城，不許蕭頌與冉顏再相見，一對有情人就這樣被生生隔開，無法在一起。冉顏回到蘇州做起了老本行仵作，只是沒有蕭頌的日子太難熬。

　　一年后，蕭頌出現在了蘇州，不知為何他不再受皇命所迫，將冉顏擁入了懷中。但同時，一個神秘男人戴著面紗，看著遠處的蕭頌冉顏說道，我絕對不會讓你離開我。看來《大唐女法醫》還沒有真正大結局，期待第二季早日與觀眾見面！